Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDF15Q99988 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF15Q99988 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GDF15Q99988 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GDF15Q99988 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GDF15Q99988 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GDF15Q99988 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GDF15Q99988 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GDF15Q99988 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GDF15Q99988 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GDF15Q99988 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GDF15Q99988 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GDF15Q99988 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GDF15Q99988 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GDF15Q99988 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GDF15Q99988 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GDF15Q99988 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GDF15Q99988 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GDF15Q99988 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GDF15Q99988 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GDF15Q99988 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GDF15Q99988 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GDF15Q99988 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GDF15Q99988 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GDF15Q99988 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GDF15Q99988 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GDF15Q99988 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GDF15Q99988 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GDF15Q99988 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GDF15Q99988 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms