Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3AQ99856 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3AQ99856 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3AQ99856 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3AQ99856 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3AQ99856 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3AQ99856 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3AQ99856 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3AQ99856 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3AQ99856 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3AQ99856 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3AQ99856 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3AQ99856 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3AQ99856 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3AQ99856 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3AQ99856 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3AQ99856 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3AQ99856 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3AQ99856 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3AQ99856 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3AQ99856 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3AQ99856 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3AQ99856 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3AQ99856 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3AQ99856 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms