Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC6Q99741 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC6Q99741 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.8 ms