Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD9AQ99638 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RAD9AQ99638 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAD9AQ99638 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD9AQ99638 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD9AQ99638 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD9AQ99638 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD9AQ99638 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD9AQ99638 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD9AQ99638 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD9AQ99638 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD9AQ99638 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD9AQ99638 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms