Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A3Q99624 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A3Q99624 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms