Protein–RNA interactions for Protein: Q99619

SPSB2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB2Q99619 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPSB2Q99619 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPSB2Q99619 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPSB2Q99619 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPSB2Q99619 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms