Protein–RNA interactions for Protein: Q99576

TSC22D3, TSC22 domain family protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D3Q99576 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSC22D3Q99576 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC22D3Q99576 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSC22D3Q99576 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms