Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGMNQ99538 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGMNQ99538 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms