Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1Q99536 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1Q99536 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1Q99536 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1Q99536 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1Q99536 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAT1Q99536 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAT1Q99536 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms