Protein–RNA interactions for Protein: Q99325

ATG40, Autophagy-related protein 40, yeastyeast

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG40Q99325 YCR041WYCR041W 333 nt6.03□□□□□ -1.44
ATG40Q99325 PIH1YHR034C 1035 nt6.02□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 ATP23YNR020C 813 nt6.02□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 SRF1YDL133W 1314 nt6.01□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 EDC3YEL015W 1656 nt6.01□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 RTC4YNL254C 1206 nt6.01□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 DPM1YPR183W 804 nt6.01□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 CMK2YOL016C 1344 nt6□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 PPS1YBR276C 2424 nt6□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 YLR112WYLR112W 420 nt6□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 PHO85YPL031C 918 nt6□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 NFS1YCL017C 1494 nt6□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 PGI1YBR196C 1665 nt6□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 TUB1YML085C 1344 nt5.99□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 ICL2YPR006C 1728 nt5.99□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 EXG2YDR261C 1689 nt5.99□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 YPR127WYPR127W 1038 nt5.99□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 KAE1YKR038C 1161 nt5.98□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 ERG27YLR100W 1044 nt5.98□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 DML1YMR211W 1428 nt5.98□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 PTH2YBL057C 627 nt5.97□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 MPE1YKL059C 1326 nt5.97□□□□□ -1.45
ATG40Q99325 PAC10YGR078C 600 nt5.96□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 YOR012WYOR012W 414 nt5.96□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 YEL023CYEL023C 2049 nt5.96□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 GUT1YHL032C 2130 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 YCR061WYCR061W 1896 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 DMC1YER179W 1005 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 THR1YHR025W 1074 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 YPL067CYPL067C 597 nt5.94□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 TDP1YBR223C 1635 nt5.94□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 MIX17YMR002W 471 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 YOR389WYOR389W 1875 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 SSC1YJR045C 1965 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 STF1YDL130W-A 261 nt5.92□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 DLD1YDL174C 1764 nt5.92□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 AGP2YBR132C 1791 nt5.92□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 ACO1YLR304C 2337 nt5.91□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 PRS4YBL068W 981 nt5.91□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 GET4YOR164C 939 nt5.91□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 MSG5YNL053W 1470 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 NUP84YDL116W 2181 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 RQC1YDR333C 2172 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 VTS1YOR359W 1572 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 HHY1YEL059W 309 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 MEU1YLR017W 1014 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 YML079WYML079W 606 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 RRN10YBL025W 438 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 YPQ1YOL092W 927 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 YOR268CYOR268C 399 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 SNT309YPR101W 528 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG40Q99325 MCH2YKL221W 1422 nt5.9□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 PLB2YMR006C 2121 nt5.89□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 HEL1YKR017C 1656 nt5.89□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 KIN1YDR122W 3195 nt5.89□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 MTR3YGR158C 753 nt5.89□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 TRR2YHR106W 1029 nt5.89□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 CST26YBR042C 1194 nt5.89□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 IRC5YFR038W 2562 nt5.88□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 YCR049CYCR049C 447 nt5.88□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 HPT1YDR399W 666 nt5.88□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 YAL045CYAL045C 309 nt5.88□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 YDR306CYDR306C 1437 nt5.88□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 NAF1YNL124W 1479 nt5.88□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 AMN1YBR158W 1650 nt5.88□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 PUP2YGR253C 783 nt5.87□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 HTZ1YOL012C 405 nt5.87□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 UME1YPL139C 1383 nt5.87□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 BRN1YBL097W 2265 nt5.86□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 CTA1YDR256C 1548 nt5.86□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.86□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 ARC35YNR035C 1029 nt5.86□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 CYB2YML054C 1776 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 NTE1YML059C 5040 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 LAT1YNL071W 1449 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 PRE5YMR314W 705 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 MBF1YOR298C-A 456 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 YPR130CYPR130C 408 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 APE4YHR113W 1473 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 TAH11YJR046W 1815 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 CIA1YDR267C 993 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 snR30snR30 606 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG40Q99325 VBA5YKR105C 1749 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 YNR005CYNR005C 405 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 NTG2YOL043C 1143 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 YCL049CYCL049C 939 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 ERG12YMR208W 1332 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 MRPL28YDR462W 444 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 RPL2BYIL018W 765 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 YOL099CYOL099C 492 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 SEC23YPR181C 2307 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 HSM3YBR272C 1443 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 TOS2YGR221C 1869 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 CEM1YER061C 1329 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 EFM1YHL039W 1758 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 RPR1RPR1 369 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 HBN1YCL026C-B 582 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 YJL045WYJL045W 1905 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 PDA1YER178W 1263 nt5.8□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 PTC7YHR076W 1032 nt5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.3 ms