Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
CDK5RAP2Q96SN8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK5RAP2Q96SN8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK5RAP2Q96SN8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms