Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NODALQ96S42 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NODALQ96S42 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NODALQ96S42 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms