Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZIM3Q96PE6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZIM3Q96PE6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.9 ms