Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms