Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INPP4AQ96PE3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INPP4AQ96PE3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
INPP4AQ96PE3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
INPP4AQ96PE3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms