Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AGAP3Q96P47 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGAP3Q96P47 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP3Q96P47 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms