Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH12Q96NR8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH12Q96NR8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms