Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C8orf49Q96NF6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf49Q96NF6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms