Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF488Q96MN9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF488Q96MN9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms