Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC138Q96M89 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC138Q96M89 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC138Q96M89 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms