Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.8■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.79■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.78■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GJD4Q96KN9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GJD4Q96KN9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
GJD4Q96KN9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
GJD4Q96KN9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GJD4Q96KN9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms