Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM87BQ96K49 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM87BQ96K49 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMEM87BQ96K49 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms