Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDHR1Q96JP9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR1Q96JP9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR1Q96JP9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR1Q96JP9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR1Q96JP9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR1Q96JP9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR1Q96JP9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR1Q96JP9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDHR1Q96JP9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDHR1Q96JP9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDHR1Q96JP9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDHR1Q96JP9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDHR1Q96JP9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDHR1Q96JP9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms