Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NEURL4Q96JN8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NEURL4Q96JN8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
NEURL4Q96JN8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
NEURL4Q96JN8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NEURL4Q96JN8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms