Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF479Q96JC4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF479Q96JC4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF479Q96JC4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF479Q96JC4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF479Q96JC4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF479Q96JC4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF479Q96JC4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF479Q96JC4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF479Q96JC4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF479Q96JC4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF479Q96JC4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF479Q96JC4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF479Q96JC4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF479Q96JC4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF479Q96JC4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF479Q96JC4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms