Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPD52L3Q96J77 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPD52L3Q96J77 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms