Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IMP4Q96G21 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IMP4Q96G21 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IMP4Q96G21 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms