Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL3Q96EH8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEURL3Q96EH8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEURL3Q96EH8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms