Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO17Q96EF6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO17Q96EF6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms