Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTHRC1Q96CG8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTHRC1Q96CG8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms