Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPTQ96BT3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPTQ96BT3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPTQ96BT3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms