Protein–RNA interactions for Protein: Q969M7

UBE2F, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2FQ969M7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2FQ969M7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2FQ969M7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms