Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCEAL3Q969E4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCEAL3Q969E4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms