Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX13Q92968 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX13Q92968 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms