Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EDAQ92838 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDAQ92838 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDAQ92838 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDAQ92838 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EDAQ92838 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDAQ92838 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDAQ92838 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EDAQ92838 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDAQ92838 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDAQ92838 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDAQ92838 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EDAQ92838 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDAQ92838 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDAQ92838 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDAQ92838 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDAQ92838 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDAQ92838 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDAQ92838 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDAQ92838 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDAQ92838 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDAQ92838 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDAQ92838 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDAQ92838 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDAQ92838 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EDAQ92838 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDAQ92838 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDAQ92838 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDAQ92838 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDAQ92838 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDAQ92838 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDAQ92838 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EDAQ92838 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDAQ92838 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDAQ92838 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDAQ92838 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDAQ92838 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDAQ92838 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDAQ92838 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDAQ92838 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EDAQ92838 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDAQ92838 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDAQ92838 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDAQ92838 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDAQ92838 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDAQ92838 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EDAQ92838 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDAQ92838 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDAQ92838 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDAQ92838 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDAQ92838 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDAQ92838 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDAQ92838 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDAQ92838 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDAQ92838 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDAQ92838 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDAQ92838 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EDAQ92838 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDAQ92838 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDAQ92838 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EDAQ92838 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDAQ92838 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDAQ92838 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDAQ92838 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDAQ92838 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDAQ92838 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDAQ92838 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDAQ92838 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDAQ92838 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDAQ92838 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDAQ92838 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDAQ92838 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EDAQ92838 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDAQ92838 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDAQ92838 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDAQ92838 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDAQ92838 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDAQ92838 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDAQ92838 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDAQ92838 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDAQ92838 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDAQ92838 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDAQ92838 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDAQ92838 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDAQ92838 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDAQ92838 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDAQ92838 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EDAQ92838 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDAQ92838 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDAQ92838 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDAQ92838 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDAQ92838 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDAQ92838 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDAQ92838 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDAQ92838 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDAQ92838 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDAQ92838 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDAQ92838 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EDAQ92838 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDAQ92838 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms