Protein–RNA interactions for Protein: Q92832

NELL1, Protein kinase C-binding protein NELL1, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL1Q92832 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NELL1Q92832 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELL1Q92832 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms