Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RORBQ92753 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORBQ92753 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORBQ92753 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RORBQ92753 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORBQ92753 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORBQ92753 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORBQ92753 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORBQ92753 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORBQ92753 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORBQ92753 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORBQ92753 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORBQ92753 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORBQ92753 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORBQ92753 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORBQ92753 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORBQ92753 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORBQ92753 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORBQ92753 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORBQ92753 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORBQ92753 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORBQ92753 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORBQ92753 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORBQ92753 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RORBQ92753 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORBQ92753 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORBQ92753 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORBQ92753 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORBQ92753 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RORBQ92753 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORBQ92753 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORBQ92753 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RORBQ92753 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RORBQ92753 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RORBQ92753 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RORBQ92753 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RORBQ92753 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORBQ92753 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORBQ92753 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORBQ92753 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RORBQ92753 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RORBQ92753 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RORBQ92753 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RORBQ92753 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RORBQ92753 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RORBQ92753 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORBQ92753 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORBQ92753 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORBQ92753 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORBQ92753 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORBQ92753 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORBQ92753 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORBQ92753 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORBQ92753 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORBQ92753 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORBQ92753 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORBQ92753 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORBQ92753 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORBQ92753 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORBQ92753 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORBQ92753 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORBQ92753 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORBQ92753 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORBQ92753 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORBQ92753 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORBQ92753 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORBQ92753 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RORBQ92753 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RORBQ92753 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RORBQ92753 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORBQ92753 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORBQ92753 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORBQ92753 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORBQ92753 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORBQ92753 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORBQ92753 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORBQ92753 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORBQ92753 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORBQ92753 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORBQ92753 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RORBQ92753 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RORBQ92753 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RORBQ92753 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RORBQ92753 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RORBQ92753 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RORBQ92753 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RORBQ92753 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RORBQ92753 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RORBQ92753 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RORBQ92753 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RORBQ92753 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RORBQ92753 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RORBQ92753 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RORBQ92753 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RORBQ92753 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RORBQ92753 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RORBQ92753 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RORBQ92753 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RORBQ92753 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORBQ92753 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms