Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCDQ92629 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms