Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUBCNQ92622 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RUBCNQ92622 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUBCNQ92622 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms