Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCSTNQ92542 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCSTNQ92542 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms