Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF8

DEDD2, DNA-binding death effector domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEDD2Q8WXF8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEDD2Q8WXF8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEDD2Q8WXF8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DEDD2Q8WXF8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DEDD2Q8WXF8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEDD2Q8WXF8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEDD2Q8WXF8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEDD2Q8WXF8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms