Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR60Q8WVS4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR60Q8WVS4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR60Q8WVS4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms