Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV93

AFG1L, AFG1-like ATPase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG1LQ8WV93 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
AFG1LQ8WV93 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFG1LQ8WV93 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AFG1LQ8WV93 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFG1LQ8WV93 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AFG1LQ8WV93 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFG1LQ8WV93 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFG1LQ8WV93 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFG1LQ8WV93 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFG1LQ8WV93 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 808.7 ms