Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HAVCR2Q8TDQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HAVCR2Q8TDQ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms