Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
DDX54Q8TDD1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
DDX54Q8TDD1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
DDX54Q8TDD1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms