Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI22

MCFD2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCFD2Q8NI22 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCFD2Q8NI22 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCFD2Q8NI22 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCFD2Q8NI22 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms