Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3C3Q8NEB9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms