Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNNM3Q8NE01 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM3Q8NE01 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNNM3Q8NE01 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM3Q8NE01 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
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