Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDG6

TDRD9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD9Q8NDG6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
TDRD9Q8NDG6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
TDRD9Q8NDG6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
TDRD9Q8NDG6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
TDRD9Q8NDG6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
TDRD9Q8NDG6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
TDRD9Q8NDG6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
TDRD9Q8NDG6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
TDRD9Q8NDG6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
TDRD9Q8NDG6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
TDRD9Q8NDG6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
TDRD9Q8NDG6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
TDRD9Q8NDG6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
TDRD9Q8NDG6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
TDRD9Q8NDG6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
TDRD9Q8NDG6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
TDRD9Q8NDG6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
TDRD9Q8NDG6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TDRD9Q8NDG6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TDRD9Q8NDG6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
TDRD9Q8NDG6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
TDRD9Q8NDG6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC42.04■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC42.01■■■■■ 4.32
TDRD9Q8NDG6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.31
TDRD9Q8NDG6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TDRD9Q8NDG6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
TDRD9Q8NDG6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
TDRD9Q8NDG6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
TDRD9Q8NDG6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
TDRD9Q8NDG6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TDRD9Q8NDG6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
TDRD9Q8NDG6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC41.98■■■■■ 4.31
TDRD9Q8NDG6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
TDRD9Q8NDG6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms