Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SUMF1Q8NBK3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUMF1Q8NBK3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms