Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5AQ8N6Q1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5AQ8N6Q1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMCO5AQ8N6Q1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
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